شماری از ویروس‌ها با اثرات مخرب مشابه بیماری ام اس شناخته شده‌اند. برخی از دانشمندان معتقدند که عفونت ها ممکن است سیستم ایمنی بدن را به سمت حمله به سلول های عصبی سوق دهد. این موضوع دانشمندان را در تنگنا قرار داده است تا نتوانند پاسخی قطعی برای سوال علت به وجود امدن بیماری ام اس چیست؟ ارائه دهند. در حقیقت، آنچه آن ها گمان می کنند این است که در سیستم ایمنی شما، ویروس یا باکتری های یک عفونت، مانند یک سلول های عصبی به نظر می آیند.
سیستم ایمنی برای مبارزه با این ویروس، سلول های تخصصی به نام سلول های تی کشنده تولید می کند. این سلول ها پس از آن که عفونت از بین رفت، در بدن شما باقی می مانند و در زمان مواجه با سلول های عصبی، آن ها را هم عامل بیگانه تصور و مورد حمله قرار می دهند. در این زمان است که ام اس آغاز می شود. یکی از ویروس های معروف که عاملی برای ایجاد ام اس است و درمان ام اس را هم با مشکل رو به رو می سازد، «اپشتین بار» است.